由于不同学科之间的SCI期刊很难进行比较和评价,中国科学院文献情报中心根据目前SCI核心库加上扩展库共7391种期刊的质量、影响力等因素以年度和学科为单位对SCI期刊进行4个等级的划分。《JCR期刊IF及分区情况》将各学科的SCI期刊分为1区(最高区)、2区、3区和4区四个等级。而各种学科也被归为13个大类及173种小类。
目前,根据SCI期刊分区表对SCI论文进行评价的模式已被国内部分高校采纳,因为它有利于鼓励科研工作者向本学科的高级区域投稿。发表在1区和2区的SCI论文,通常被认为是该学科领域的比较重要的成果。